Στεγάζεται σε παλαιό κτίριο σιδηροδρομικού σταθμού (σταθμός Καρατζόβας) και παρά το ότι είναι δυσανάλογα μικρό, είναι εξαιρετικά οργανωμένο και διαρρυθμισμένο ώστε να δίνει τη δυνατότητα στον επισκέπτη να αποκτήσει σαφή εικόνα της περιοχής. Ιδιαίτερο ενδιαφέρον παρουσιάζει το τμήμα παλαιοντολογίας που περιλαμβάνει απολιθώματα φυτικών και ζωικών οργανισμών που έζησαν εκατομμύρια χρόνια πριν, καθώς και φωτογραφίες φυτών που ευδοκιμούν στα βουνά της περιοχής. Σε ειδική αίθουσα εκτίθενται παραδοσιακές φορεσιές διαφόρων περιοχών της Αλμωπίας.
Στο Μουσείο της Φυσικής Ιστορίας Αριδαίας, λειτουργούν σήμερα τέσσερεις αίθουσες με εκθέματα τα οποία εμπλουτίζονται καθημερινά.
Αίθουσα απολιθωμάτων και παλαιοντολογίας
Υπάρχουν εκθέματα απολιθωμάτων που βρέθηκαν από ανασκαφές στην Αλμωπία και από άλλες περιοχές της Ελλάδας. Σημαντικά είναι τα εκθέματα των απολιθωμένων οστών της Ursus Spelaeus Αρκούδας των σπηλαίων) (κρανίο και απολιθωμένα οστά) που βρέθηκαν στο σπήλαιο Β του σπηλαιοπάρκου των Λουτρών κατά τις ανασκαφές που γίνονται από το τμήμα Γεωλογίας - Παλαιοντολογίας του Α.Π.Θ. με υπεύθυνη την επικ. καθ. dr. Τσουκαλά Ευαγγελία. Επίσης εκτίθενται απολιθώματα από Τριλοβίτες ηλικίας 500 εκατομμυρίων χρόνων περίπου. Επίσης σε ειδικό χώρο βλέπουμε συλλογές από ορυκτά και πετρώματα χαρακτηριστικά της Αλμωπίας και άλλων περιοχών της Ελλάδας.
Αίθουσα Φυτολογίας
Εκτίθενται φυτά και χαρακτηριστικά είδη πανίδας της περιοχής καθώς και φωτογραφικό υλικό από διάφορες περιοχές της Ελλάδας. Σε ειδικές αίθουσες του Μουσείου έχουμε τη διοργάνωση περιοδικών θεματικών εκθέσεων. Την τρέχουσα περίοδο έχουμε έκθεση παραδοσιακών στολών της περιοχής μας και σε άλλη αίθουσα λειτουργεί έκθεση παραδοσιακών μουσικών οργάνων
Συντάκτης: Φωτεινή Αναστασοπούλου