Βρίσκεται στην Απείρανθο. Μουσείο με σπουδαία δράση, καθώς έχει φιλοξενήσει και διοργανώσει συνέδρια και εκδηλώσεις, με θέματα που άπτονται της χλωρίδας, της πανίδας και της οικολογίας.
Εγκαινιάστηκε το 1996 και διαθέτει ειδικά τμήματα αφιερωμένα στη θάλασσα και στην ξηρά. Στο πρώτο, υπάρχει κι ένα μεγάλο φυσικό ενυδρείο, καθώς και μία υπέροχη συλλογή από 265 όστρακα του νησιού.
Στο τμήμα που αφορά την ξηρά, ξεχωρίζει η συλλογή της χλωρίδας που βρέθηκε στην υδρολογική λεκάνη του χειμάρρου Περαχωρίτη, κοντά στο χωριό.
Στο ίδιο τμήμα, φιλοξενούνται δείγματα της πανίδας της Νάξου, με κυρίαρχα τα οστά από διάφορα θηλαστικά του νησιού.
Συντάκτης: Φωτεινή Αναστασοπούλου